A kis pónik az első részben megtalálták mi a módja annak hogy megmentsék a kristály várost, melyhez egy dolog hiányzik és az pedig a kristály szív, melyet a gonosz elrejtett. A pónik feladata lesz a kristálypónikat emlékeztetni a múltra, eközben pedig Twilight és Spike elmennek megkeresni a kristály szívet mely megadja a pónik hitét hogy együtt tudjanak harcolni a gonosz ellen.